SMK Ma’arif NU Kajen memiliki program Kajian Kitab Kuning (KAKIKU) pada awalnya dilaksanakan hari kamis sepulang sekolah, namun kemudian diadakan setiap hari Senin secara bergantian dengan upacara bendera. Dalam kajian ini, siswa, guru, dan tenaga administrasi sekolah bersama-sama mengkaji kitab Safinatus Sholah, yang berisi panduan tentang tata cara ibadah dalam Islam.
